| 1 | 立命館大学 | 3:34:32 | — | |
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| 2 | 関西学院大学 | 3:38:14 | +3:42 | |
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| 3 | びわこ学院大学 | 3:40:25 | +5:53 | |
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| 4 | 京都大学 | 3:42:55 | +8:23 | |
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| 5 | 京都産業大学 | 3:43:08 | +8:36 | |
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| 6 | 大阪経済大学 | 3:44:12 | +9:40 | |
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| 7 | 関西大学 | 3:45:00 | +10:28 | |
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| 8 | 龍谷大学 | 3:47:17 | +12:45 | |
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| 9 | 近畿大学 | 3:49:10 | +14:38 | |
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| 10 | 大阪体育大学 | 3:51:22 | +16:50 | |
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| 11 | 神戸大学 | 3:51:32 | +17:00 | |
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| 12 | 佛教大学 | 3:52:37 | +18:05 | |
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| 13 | 大阪大学 | 3:53:47 | +19:15 | |
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| 14 | 大阪学院大学 | 3:54:26 | +19:54 | |
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| 15 | 兵庫県立大学 | 4:05:07 | +30:35 | |
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